La segmentación es un proceso de análisis de imagen en el que una imagen digital se segmenta o divide en varias partes, separándose en diferentes elementos, para su posterior análisis. Esta técnica se usa tanto en imágenes 2D (microscopía)  como en 3D (tomografía computerizada, microscopia confocal, etc).

Mediante diferentes softwares separamos digitalmente las diferentes partes de la imagen, las analizamos y las cuantificamos, obteniendo la mayor cantidad posible de información y datos necesarios para el investigador en sus estudios.